Svits det hakkede løg og brun køde,t imens der røres godt, så kødet ikke steges i store klumper. Tilsæt gulerødder, hvidløg og tomater samt krydderierne. Lad det stege 5 min.
Fordel halvdelen af kødsaucen i et smurt ovnfast fad. Fordel kartoffelskiver på kødsaucen og drys med salt & peber. Læg herefter endnu et lag kødsauce over. Fordel derefter squashskiverne på kødsaucen og dryp lidt olivenolie på skiverne og drys med salt og peber.
Stil moussakaen i ovnen ved 200 grader i 20 min.
Imens piskes yoghurt, æg, stødt muskatnød og salt og peber sammen. Efter de 20 min fordeles yoghurtmassen over moussakaen og osten drysses over til sidst. Derefter stiles moussakaen igen i ovnen 20 min. til den er gylden.